O Projeto Modelagem de Perda de Biodiversidade analisa os impactos causados nos vertebrados em função das atividades de exploração madeireira, fogo, pastos abandonados e assentamentos de seres humanos. As informações geradas são incorporadas ao Sistema de Informação Geográfica (SIG) e imagens de satélites para prever o efeito da alteração da biodiversidade em função do uso da terra em larga escala. A expectativa é subsidiar os tomadores de decisões quanto aos planos para Amazônia do ponto de vista da fauna, a partir de uma análise de conseqüências e riscos.

O projeto atua em dois diferentes cenários: na região central e oriental da Amazônia. A primeira trata-se de uma nova fronteira de colonização e atividades econômicas ao longo da rodovia Cuiabá-Santarém. A segunda é uma fronteira antiga de colonização e uma área altamente perturbada no sul do Pará, ao longo da rodovia Transamazônica. Ambas as regiões apresentam uma grande diversidade de uso da terra, como áreas de preservação, reservas extrativistas, florestas com extração de madeira, agricultura de subsistência, entre outras. O projeto pretende determinar: 1) como as mudanças nos vertebrados, a distribuição e a escala co-variam através do distúrbio; 2) como variáveis ambientais moldam padrões de biodiversidade; 3) se diferentes grupos respondem as mesmas variações ambientais e diferentes tipos de distúrbios e 4) o impacto de atores chave (pequenos proprietários, madeireiros, fazendeiros de soja) no uso do habitat dos vertebrados. O Projeto fará uma pesquisa literária da distribuição, preferências do habitat, dieta e a ecologia dos animais alvo, associado com levantamento de campo para desenhar um banco de dados para ser sobreposto às mudanças na paisagem.